Une Convention pour la conception et le réaménagement du Musée Naval militaire et des espaces muséaux de l’Arsenal a été signé avec la Marine militaire le 6 août 2013, grâce, entre autres, à la création d’un Comité scientifique et à la désignation d’un Responsable unique de la procédure.
Le projet interviendra sur quelques espaces historiques importants dans l’Arsenal: le Pavillon des Navires, avec l’exposition d’un grand nombre de bateaux historiques anciens et modernes, de bunkers de la Grande Guerre et d’ un sous-marin.